حضرت آيت الله خامنه اى رهبر معظم انقلاب اسلامى در پيام مهمى به مناسبت حضور با عظمت و پرشور ملت ايران در مرحله دوم انتخابات رياست جمهورى، ضمن تبريك اين پيروزى درخشان خطاب به ملت تصريح كردند: شما با نمايش باشكوهى از همبستگى ملى و مشاركت عمومى، عزم راسخ خود براى دفاع از استقلال ملى و پايبندى خود به حراست شجاعانه از منافع كشور و نظام جمهورى اسلامى را در عمل ثابت كرديد. متن پيام مقام معظم رهبرى به اين شرح است:

بسم الله الرحمن الرحيم
ملت بزرگ و عزيز ايران
قلم ناتوان اينجانب قادر نيست همت بلند و انگيزه عميق و بصيرت نافذ و شور مخلصانه شما را توصيف كند. شما در دو جمعه پى درپى با اقدامى پرمعنا و پيامى رسا، بار ديگر عظمت خود را به جهانيان نشان داديد و قدرت خود را به رخ بدخواهان و دشمنان كينه توز كشيديد. شما عزم راسخ خود را بر دفاع از استقلال ملى فرياد زديد. شما پايبندى خودرا به حراست شجاعانه از منافع كشور و نظام جمهورى اسلامى كه تأمين كننده همه آرمانهاى اسلامى و انقلابى است، در عمل ثابت كرديد. شما نمايش باشكوهى از همبستگى ملى و مشاركت عمومى در برابر چشم دوست و دشمن قرارداديد و راز استحكام و اقتدار خود در رويارويى با زياده خواهيهاى استكبارى را مجسم ساختيد. اينك دشمن شما عليرغم ياوه گوييهاى خود، در برابرعظمت و شفافيت مردم سالارى شما، در دل خود تحقير مى شود و امت بزرگ اسلامى گسترده در سراسر جهان، از ظرفيت و توانايى نظام اسلامى كه مظهر هويت جمعى مسلمانان است به خود مى بالد.
اين پيروزى درخشان ملت، مظهر رحمت الهى بر شما مردم مؤمن و جوانان صادق و صالح و نصرتى از سوى حضرت احديت است. اينجانب خاشعانه جبهه سپاس برخاك مى نهم و دوام لطف و رحمت و نصرت ذات اقدس الهى را براى شما ملت عزيز و وفادار مسألت مى كنم و خود و شما را به شكر و ذكر و خضوع و رفق و مدارا توصيه مى نمايم. اينك با تبريك اين مسؤوليت خطير به رئيس جمهور منتخب جناب آقاى دكتر محمود احمدى نژاد، نكاتى را به ايشان و همه آحاد ملت عرض مى كنم.
۱- دوران انتخابات، دوران شور و التهاب است. با پايان گرفتن انتخابات بايد هيجان و التهاب، جاى خود را به متانت و رفاقت و همكارى بدهد. همه، چه طرفداران نامزد منتخب و چه طرفداران ديگر نامزدهاى محترم بايد از خود ظرفيت و حلم و دانايى بروز دهند. هيچ احساسى، چه شادمانى و چه ناشادمانى، نبايد كسى را به رفتارى برخلاف شأن يك انسان متعهد و خردمند وادار سازد. وحدت ملى و رفق و مدارا، تضمين كننده امنيت كشور و خنثى كننده هر توطئه است.
۲- اكنون پس از هفته ها گفتن و شنودن، نوبت كار و اقدام است. رئيس جمهور منتخب تا پذيرش رسمى مسؤوليت، داراى فرصت ارزشمندى است، شايسته است اين فرصت، بدون فوت وقت، مصروف اقدامهايى شود كه شروع مسؤوليت خطير رياست جمهورى بدان نيازمند است. همه مسؤولان كشور و نخبگان بخشهاى گوناگون، يارى ايشان را تعهدى انسانى و اسلامى بشمارند.
۳- نقش مؤثر و تعيين كننده نامزدهاى رياست جمهورى در خلق اين حماسه بزرگ ملى، انكار ناپذير و سپاس از آنان برهمگان لازم است. اينجانب تشكر وافر خود را به همه آقايان بويژه به جناب حجت الاسلام والمسلمين آقاى هاشمى رفسنجانى كه خود از ذخاير انقلاب و از چهره هاى برجسته نظام جمهورى اسلامى ايرانند تقديم مى دارم و اميدوارم اين برادر عزيزم و همسنگر ديرين مانند هميشه در عرصه هاى مهم نظام اسلامى نقش آفرين باشند.
۴- لازم مى دانم از همه آحاد ملت عزيز كه يكبار ديگر حادثه اى بزرگ در جهت رشد و اعتلاى كشور آفريدند و از همه كسانى كه به اين آزمايش بزرگ شور و حال بخشيدند، بويژه حضرات مراجع معظم و علماى اعلام و نخبگان دانشگاهى و اقشار گوناگون اجتماعى و سياسى و فرهنگى و نيز از دستگاههاى خبرى بويژه صداوسيما كه مبتكرانه دراين حركت عمومى نقش آفريد و از همه خبرنگاران و فعالان عرصه خبر و تحليل و نيز از دست اندركاران برگزارى انتخابات، شوراى محترم نگهبان، وزارت كشور، استانداران، فرمانداران، عوامل اجرايى و نظارتى، نيروهاى انتظامى، امنيتى و اطلاعاتى و قضايى كه با مجاهدتى بزرگ، امنيت اين ايام را تأمين كردند، صميمانه سپاسگزارى كنم و براى همه آنان پاداش و ثواب الهى مسألت نمايم. بار ديگر خداوند متعال را به خاطر نعمت و رحمتش بر اين ملت و اين كشور شكر مى گزارم و بر ساحت حضرت بقية الله ارواحنا فداه، سلامى مخلصانه معروض مى دارم و رعايت و عنايت و دعاى آن بزرگوار را مى طلبم.
والسلام على عبادالله الصالحين
سيدعلى خامنه اى ـ ‎/۴ تير‎/ ۱۳۸۴

سخنگوى شوراى نگهبان گفت:نظارت خوب بر اين انتخابات، كارنامه روشنى از نقش شوراى نگهبان را به مردم ارائه داد.
به گزارش فارس غلامحسين الهام ديروز در مصاحبه مطبوعاتى با خبرنگاران با تبريك برگزارى انتخابات پرشور و رقابتى گفت: تاكنون با توجه به اطلاعات رسيده از شعب اخذ آراى سراسر كشور، حدود ۲۸ ميليون نفر در دور دوم انتخابات شركت كردند كه اين حضور در مقايسه با دور اول به ويژه در تهران بسيار چشمگير و ستودنى بوده است. وى افزود: نتايج شمارش آرا نشان مى دهد منتخب مردم ايران، حدود ۶۲ درصد آرا را كسب كرده است.
عضو حقوقدان شوراى نگهبان خاطرنشان كرد: بدليل برخى نگرانى ها در مرحله دوم انتخابات در كاهش آراء و روى كار آمدن رئيس جمهور با پشتوانه رأى پايين، خوشبختانه ميزان فعلى آرا قابل قبول است. عضو حقوقدان شوراى نگهبان همچنين برخى تخلفات در اين دور از انتخابات را عادى و جزيى خواند و گفت: تخلفات جزيى صورت گرفته هيچگونه خللى در روند برگزارى انتخابات ايجاد نكرد. الهام در خصوص افزايش تعداد بازرسان در اين دور از انتخابات بر سر صندوق هاى اخذ رأى گفت: اين افزايش ناگهانى به دليل جوان و بى تجربگى بازرسان از قوانين انتخاباتى و نوع مداخلات آنان مشكلاتى را در برخى شعب به ويژه تهران ايجاد كرد.
سخنگوى شوراى نگهبان با انتقاد از رسانه ملى مبنى بر رفتار تبعيض  آميز در به اختيار گذاشتن امكان اطلاع  رسانى نتايج انتخابات، گفت: اين جاى گلايه دارد كه رسانه ملى تنها ۴ دقيقه به شوراى نگهبان فرصت داد تا در خصوص انتخابات به مردم اطلاع رسانى كند.
عضو حقوقدان شوراى نگهبان در پايان با بيان اين كه طبق قانون يك ماه قبل از اتمام دوره خدمت دولت فعلى بايد وضعيت رئيس جمهور جديد نهايى شده باشد، گفت: پس از تأييد نهايى انتخابات از سوى شوراى نگهبان، حكم وى در ۱۲ مرداد ماه از سوى مقام معظم رهبرى تنفيذ و مراسم تحليف از رئيس جمهور جديد در مجلس برگزار خواهد شد.

گروه سياسى: شوراى نگهبان قانون اساسى با صدور بيانيه اى تأكيد كرد كه ملت ايران از حق تعيين سرنوشت خود به عنوان يك حق الهى پاسدارى كرد. در اين بيانيه آمده است: ملت شريف و سرافراز ايران اسلامى يكبار ديگر به ميدان آمد تا به جهانيان ثابت كند كه آزاد است و آزادانديش، به ميدان آمد تا از حق تعيين سرنوشت خود به عنوان يك حق الهى پاسدارى كند. در اين بيانيه آمده است: ملت ايران به ميدان آمد تا با حضور پرشور خود بيعتى دوباره داشته باشد با اسلام و ولايت به ميدان آمد تا نداى عدالت طلبى و حق خواهى خود را به گوش همه برساند.

گروه سياسى ـ ستاد انتخابات مردمى محمود احمدى نژاد منتخب نهمين دوره انتخابات رياست جمهورى، در پيامى به نتيجه رسيدن انتخابات رياست جمهورى را پيروزى بزرگ براى ايران اسلامى دانست و آن را به يكايك ملت ايران تبريك و تهنيت گفت. به گزارش روز شنبه اين ستاد، در اين پيام تأكيد شده است: محمود احمدى نژاد آراى شما را كه به عنوان امانتى گرانسنگ نزد او به وديعه سپرده ايد گرامى مى دارد و تمام وجود و هم و غم خود را مصروف پاسداشت اعتمادى خواهد كرد كه ملت ايران در سوم تير به وى ابراز كردند.

گروه سياسى: محمود احمدى نژاد، شهردار تهران با بيش از ۱۷ ميليون رأى به عنوان ششمين رئيس جمهور ايران انتخاب شد. با پايان يافتن كار شمارش آرا در داخل و خارج از كشور، آمار نهايى نتايج آراى ريخته شده در صندوق هاى مرحله دوم نهمين انتخابات رياست جمهورى اعلام شد. به گزارش پايگاه اطلاع رسانى وزارت كشور، سرانجام كار شمارش آرا كه از نيمه شب شنبه آغاز شده بود، بعد از ظهر ديروز با پايان يافتن شمارش آراى استان كرمانشاه و صندوق هاى اخذ رأى در خارج از كشور نهايى شد و آمار آراى اخذ شده در داخل و خارج از كشور به ۲۷ ميليون و۹۵۹ هزار و۲۵۳ رأى رسيد. براساس اين گزارش، از اين تعداد، محمود احمدى نژاد در مجموع تعداد ۱۷ ميليون و ۲۴۸ هزار و۷۸۲ رأى را به خود اختصاص داده است. همچنين اكبر هاشمى رفسنجانى بهرمانى ۱۰ ميليون و۴۶ هزار و ۷۰۱ رأى را به خود اختصاص داده است. اين گزارش مى افزايد: تعداد۶۶۳ هزار و۷۷۰ رأى نيز به عنوان آراى باطله شمارش شده است. اين گزارش همچنين حاكى است؛ آمار نهايى ريخته شده در صندوق هاى خارج از كشور به شرح زير اعلام كل آراى اخذ شده ۷۶ هزار و ۲۴۵ رأى ـ اكبر هاشمى بهرمانى ۴۳ هزار و ۴۸۹ رأى ـ محمود احمدى نژاد ۳۰ هزار و ۴۷۳ رأى ـ آراى باطله ۲ هزار و ۲۸۳ رأى